Do badań modyfikacji białek wykorzystujemy spektrometrię mas – w postaci układu chromatograf cieczowy – tandemowy spektrometr mas (LC-ESI-MSn) firmy Waters®.
Do modyfikacji potranslacyjnych białek, rozumianych jako kowalencyjne przyłączenie grup(y) chemicznych do cząsteczki białka, zalicza się m.in. metylację, acetylację, glikację i ubikwitynację. Modyfikacje te mają wpływ na większość funkcji białek, w tym: zmiany w strukturze, czas życia, lokalizację w komórce, aktywność enzymatyczną, czy też oddziaływanie z innymi cząsteczkami. Niezwykle istotna jest zatem identyfikacja modyfikacji białka oraz określenie reszt aminokwasowych, których ona dotyczy. Pozwala to na dokładniejsze poznanie funkcji białek, zwłaszcza w kontekście powstawania stanów chorobowych.