Centralne Laboratorium Naukowe Uniwersytetu Medycznego w Łodzi dysponuje wysokiej klasy sprzętem do sekwencjonowania DNA, 16-kapilarnym sekwenatorem 3130xl Genetic Analyser (Applied Biosystems).

Oferujemy usługi w zakresie:
- sekwencjonowania genomów bakteryjnych (DNA plazmidowe),
- sekwencjonowania amplikonów,
- genotypowania fragmentów DNA,
- analizy profilu metylacji DNA w komórkach,
- analizy MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification).
Analiza sekwencji przeprowadzana jest w oparciu o cykliczną metodę terminacji łańcucha z wykorzystaniem odczynników firmy Applied Biosystems (ABI Prism Big Dye terminator Cycle Sequencing Kit). Usługa obejmuje:
- PCR sekwencyjny z użyciem starterów dostarczonych przez zleceniodawcę,
- oczyszczanie po sekwencjonowaniu,
- elektroforezę kapilarną produktów reakcji sekwencjonowania.
Wyniki przedstawiane są w formie dokumentu .ab1 – otwierane przez program Sequence Scanner lub Chromas.
Istnieje możliwość, po uprzednim ustaleniu, przeprowadzenia kompleksowej analizy obejmującej:
- izolację DNA/RNA,
- zaprojektowanie primerów,
- optymalizację reakcji PCR,
- amplifikację fragmentów DNA/cDNA do sekwencjonowania,
- oczyszczenie produktu PCR,
- reakcję sekwencjonowania j.w.
- analizę wyników.
Uwzględniamy indywidualne potrzeby osób zainteresowanych.
W sprawie zleceń usług oferowanych przez Laboratorium oraz sposobu przygotowania próbek do analizy prosimy kontaktować się z:
- dr Dominiką Kulczycką-Wojdala dominika.kulczycka-wojdala@umed.lodz.pl
tel. 42 272 5650 - dr Bożeną Szymańską bozena.szymanska@umed.lodz.pl
tel. 42 272 5650